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毛细管电泳色谱仪在DNA分析中的应用

类别:技术参数 出处:维库仪器仪表网 发布于:2017-12-29 15:19:06 | 473 次阅读

  高效毛细管电泳色谱仪简称毛细管电泳仪(CE),是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,利用荷电粒子之间的淌度差异和分配系数差异进行分离,是分析科学继高效液相色谱仪之后的又一重大进展,使分析科学从微升级进入到了纳升级水平,不仅使单细胞乃至单分子分析成为可能,也使蛋白质和核酸等生物大分子分析有了新的转机。目前,生命科学领域的分析仪器正向着微型化、集成化和自动化的方向发展,高分辨率、快速、耗样量少、低成本和高通量的毛细管电泳的应用前景将会非常广阔。

 一、使微量PCR扩增及产物检测整合成自动化体系:

  微型硅胶PCR反应器与CE芯片可整合成DNA分析系统。β-球蛋白基因在15min内可从M13中扩增出来,然后在120s内在CE芯片上得到快速分离,使整个PCR-CE过程在20min内完成。而且从毛细管的出口处可收集经过分离纯化的DNA片段,该片段可转移到正电荷膜上进行杂交。此方法可代替和简化传统的DNA片段回收方式,自动化程度高,分离纯度高。此外,由于毛细管出口小,片段易于在杂交膜上富集,皮克级DNA都能经杂交检测到。这使PCR扩增、CE分离纯化和DNA杂交三个过程实现集成化和系统化成为可能。

 二、使高通量DNA分析和测序成为可能:

  放射性阵列毛细管电泳微板与扫描仪联用可实现高通量的DNA检测。电泳微板包括一个普通中央阳极槽,与96个微型分离通道相连,使用激发的旋转共聚焦扫描检测器检测四色通道,96个样品采用压力式毛细管阵列系统平行进样,可使96个PBR322限制性内切酶片段在120s内得到高效分离。若同时使用40块微板,每块微板上有384个分离通道,则一次进样量可达15000个,从而达到高通量DNA分析和测序的目的。此外,CE不仅可对DNA的合成片段进行纯度检验,对PCR扩增的DNA模板进行纯化和从反应体系中去除,还可进行文库建立或复制,启动子作用方式检测自然和人工合成RNA的结构。

  由于CE开发和应用的历史不如色谱长,对于各种不同物质的分离技术和方法还不够完善和成熟,在实际分析过程中需要花较长时间放在方法的建立上。

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